《应用数学》
文章摘要:【目的】探究脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)鳃组织在渐变式低氧—复氧下的分子调控机制,为今后深入了解脊尾白虾低氧适应的基础和养殖育种研究提供参考。【方法】通过渐变式低氧—复氧的方法获得脊尾白虾在低氧0、3和6 h及复氧1和8 h的鳃组织,利用Illumina HiSeqTM 4000平台进行转录组测序分析,经过滤和Trinity组装获得基因,并选取Nr、Swiss-Prot、KEGG和COG/KOG数据库进行比对和注释,对差异表达基因进行鉴定和差异基因趋势分析;随机选取5个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】转录组测序结果组装注释共获得了93227个基因,其中4750个基因被鉴定为差异表达基因;对所有差异表达基因进行趋势分析,获得6个显著富集(P<0.01)的基因表达模式,重点讨论低氧过程中先上升后下降,复氧后再上升的基因表达模式。KEGG通路富集分析显示基因显著富集(P<0.05)在核糖体,碳代谢,氧化磷酸化,内质网蛋白质加工,氨基酸生物合成,糖酵解/糖异生,谷胱甘肽代谢和蛋白输出相关通路上,说明低氧—复氧对脊尾白虾鳃组织蛋白质合成和能量代谢有显著影响。【结论】脊尾白虾鳃组织在受到低氧胁迫时,早期可能通过合成蛋白质,提高代谢能力来抵御低氧环境,随着低氧时间延长,物质合成和能量代谢活动均受影响而下降;在复氧后,随着复氧时间的延长,蛋白质合成和能量代谢水平又逐渐升高恢复。
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